脑干三叉神经束核与感觉核出现异常兴奋性放电。

丘脑存在损害情况。

三叉神经感觉根、半月节或周围支受到压迫或损害，引发脱髓鞘性病变，常见诱因包括解剖结构异常、血管畸形、骨孔压骨膜炎症、动脉硬化等。

上、下颌骨存在病理性骨腔。

三叉神经痛的病因较为复杂，但其核心机制是颅脑细胞异常放电，导致三叉神经脑干细胞诱发电位产生，进而引发疼痛发作。这种诱发电位易受轻微刺激触发，甚至可自发出现，因此三叉神经痛常反复发作，治疗难度较大。